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Archiv verlassen und diese Seite im Standarddesign anzeigen : jmol



kimi
09.03.2008, 00:33
hallo,

Ich informiere mich grad für die Schule über die DNA und solche Sachen. Für die Visualisierung gibt es da ein schönes Java-applet, welches "JMOL" heißt. Mit diesem kann man die DNA aus allen Richtungen ankucken, drehen und was man halt machen will.
Das Problem liegt gleich an dem "java" - Format des Programms: Ich habe über synaptic das Paket "sun-java6-jre" installiert.
Firefox neugestartet, sagt er immer noch er habe kein jre installiert. Brauche ich da ein spezielles Plugin? konnte auf java.com bisher noch keines finden.
Wenn man jmol runterlädt, bekommt man ein .zip oder .tar.gz - Archiv.
Entpackt man dieses, bekommt man eine vielzahl von *.jar und ein paar anderer Dateien. klickt man nun eine dieser Dateien an, werden diese als "java-archiv" beschriebenen Dateien mit ark geöffnet, anstatt als programm zu starten.
Frage: fehlen mir noch plugins? oder mache ich irgendeinen anderen fehler, der mich hindert, diese Java-Applikation zum laufen zu bringen?

http://sourceforge.net/project/showfiles.php?group_id=23629

Grüße

kimi

slackfan
09.03.2008, 01:29
Java Archive startet man für gewöhnlich mit dem Befehl 'java -jar archivname.jar'. Das Firefox-Problem hat damit aber nichts zu tun und ist eine Sache für sich. Da wird dir mit den gegebenen Informationen keiner helfen können. Gib mal im Firefox about:plugins ein und schau, ob was dazu da steht.

sim4000
09.03.2008, 01:33
Du benötigst noch das dazugehörige Java Plugin für den Firefox. Ich habe bei mir in meiner SuSE 10.3 Java 6 installiert. Da heißt das Plugin-Paket so:
<root> (/home/sim4000) rpm -qa java*
java-1_6_0-sun-plugin-1.6.0.u4-0.1
<weitere Prakete>Schau mal in der Paketverwaltung. Da müsste das zu finden sein.

chb
09.03.2008, 01:36
http://pymol.sourceforge.net/ - ist auch ein nettes Tool für sowas, allerdings etwas überladen für diesen Zweck :)

kimi
09.03.2008, 22:32
Danke schonmal für die Infos.

about:plugins:


Shockwave Flash

Dateiname: libflashplayer.so
Shockwave Flash 9.0 r115

MIME-Typ Beschreibung Endungen Aktiviert
application/x-shockwave-flash Shockwave Flash swf Ja
application/futuresplash FutureSplash Player spl Ja

Also nichts von einem java plugin. habe mich umgeschaut, kein solches Paket gefunden.

Allerdings hat mir die Paketverwaltung folgendes Paket:


java-gcj-compat-plugin

Web browser plugin to execute Java (tm) applets using gij
gcjwebplugin is a little web browser plugin to execute Java (tm) applets.
It is targeted for Mozilla and compatible browsers that support the NPAPI.

The package unconditionally uses the gij runtime.
Könnte das etwas sein?

EDIT:
paket gefunden namens "sun-java6-plugin". sollte damit funktionieren.

Grüße

kimi

EDIT2:

about:plugins


Installierte Plugins
Erfahren Sie mehr über Browser-Plugins auf mozilla.org.
Hilfe zum Installieren von Plugins ist verfügbar auf plugindoc.mozdev.org.
Shockwave Flash

Dateiname: libflashplayer.so
Shockwave Flash 9.0 r115

MIME-Typ Beschreibung Endungen Aktiviert
application/x-shockwave-flash Shockwave Flash swf Ja
application/futuresplash FutureSplash Player spl Ja
Java(TM) Plug-in 1.6.0_03-b05

Dateiname: libjavaplugin_oji.so
Java(TM) Plug-in 1.6.0_03

MIME-Typ Beschreibung Endungen Aktiviert
application/x-java-vm Java Ja
application/x-java-applet Java Ja
application/x-java-applet;version=1.1 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.1.1 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.1.2 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.1.3 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.2 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.2.1 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.2.2 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.3 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.3.1 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.4 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.4.1 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.4.2 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.5 Java Ja
application/x-java-applet;version=1.6 Java Ja
application/x-java-applet;jpi-version=1.6.0_03 Java Ja
application/x-java-bean Java Ja
application/x-java-bean;version=1.1 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.1.1 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.1.2 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.1.3 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.2 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.2.1 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.2.2 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.3 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.3.1 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.4 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.4.1 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.4.2 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.5 Java Ja
application/x-java-bean;version=1.6 Java Ja
application/x-java-bean;jpi-version=1.6.0_03 Java

Java Zeugs funktioniert jetzt zwar im Browser, habe jedoch noch keine Seite gefunden die jmol komplett im Netz anbietet. das mit
java /pfad/zum/archiv richtet allerdings nichts aus. Es gibt folgende Fehlermeldung:

seba@Sebastian:~/Downloads/jmol-11.4.RC9-binary/jmol-11.4.RC9$ java Jmol.jar
Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: Jmol/jar
seba@Sebastian:~/Downloads/jmol-11.4.RC9-binary/jmol-11.4.RC9$


gruß

kimi