Probleme beim compilieren von R

[Naich]

Hallo,
erstmal möchte ich mich entschuldigen, wenn die Hilfeschreie von Anfängern wie mir vielleicht nerven. Aber ich habe versucht die SuFu und Google zu benutzen, habe leider zu wenig Vokabular-Ahnung, um Antworten zu finden.
Hier mein Problem:

Ich habe mir R-2.4.0 als *.tar.gz datei runergeladen, da es bei Yast und Apt nicht drin war. Bei dieser Gelegenheit: Ich benutzte SUSE 10.1

Dannach habe ich es mit tar - xzf R-2.4.0.tar.gz nach usr/local/programs/R-2.4.0 entpackt
(weiß auch nicht wo man sonst so Programme hinpacken sollte?---Hint? )

Nun das Dilemma: In der INSTALL steht ich soll ./configure laufen lassen, das sieht so aus:

laptop:/usr/local/programs/R-2.4.0 # ./configure
checking build system type... i686-pc-linux-gnu
checking host system type... i686-pc-linux-gnu
loading site script './config.site'
loading build specific script './config.site'
checking for pwd... /bin/pwd
checking whether builddir is srcdir... yes
checking for working aclocal... missing
checking for working autoconf... missing
checking for working automake... missing
checking for working autoheader... missing
checking for working makeinfo... missing
checking for gawk... gawk
checking for egrep... grep -E
checking whether ln -s works... yes
checking for ranlib... ranlib
checking for bison... no
checking for byacc... no
checking for ar... ar
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking for sed... /usr/bin/sed
checking for less... /usr/bin/less
checking for perl... /usr/bin/perl
checking whether perl version is at least 5.004... yes
checking for dvips... /usr/bin/dvips
checking for tex... /usr/bin/tex
checking for latex... /usr/bin/latex
checking for makeindex... /usr/bin/makeindex
checking for pdftex... /usr/bin/pdftex
checking for pdflatex... /usr/bin/pdflatex
checking for $(SHELL)... no
checking for $(top_srcdir)/tools/missing... no
checking for makeinfo... no
checking for makeinfo... no
checking for unzip... /usr/bin/unzip
checking for zip... /usr/bin/zip
checking for gzip... /usr/bin/gzip
checking for firefox... /usr/bin/firefox
using default browser ... /usr/bin/firefox
checking for acroread... /usr/X11R6/bin/acroread
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking whether gcc needs -traditional... no
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for gfortran... gfortran
checking whether we are using the GNU Fortran 77 compiler... yes
checking whether gfortran accepts -g... yes
checking for g++... g++
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ accepts -g... yes
checking how to run the C++ preprocessor... g++ -E
checking whether __attribute__((visibility())) is supported... yes
checking whether gcc accepts -fvisibility... yes
checking whether gfortran accepts -fvisibility... yes
checking for a sed that does not truncate output... /usr/bin/sed
checking for ld used by gcc... /usr/i586-suse-linux/bin/ld
checking if the linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) is GNU ld... yes
checking for /usr/i586-suse-linux/bin/ld option to reload object files... -r
checking for BSD-compatible nm... /usr/bin/nm -B
checking how to recognise dependent libraries... pass_all
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking dlfcn.h usability... yes
checking dlfcn.h presence... yes
checking for dlfcn.h... yes
checking the maximum length of command line arguments... 32768
checking command to parse /usr/bin/nm -B output from gcc object... ok
checking for objdir... .libs
checking for ranlib... (cached) ranlib
checking for strip... strip
checking if gcc static flag  works... yes
checking if gcc supports -fno-rtti -fno-exceptions... no
checking for gcc option to produce PIC... -fPIC
checking if gcc PIC flag -fPIC works... yes
checking if gcc supports -c -o file.o... yes
checking whether the gcc linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) supports shared libraries... yes
checking whether -lc should be explicitly linked in... no
checking dynamic linker characteristics... GNU/Linux ld.so
checking how to hardcode library paths into programs... immediate
checking whether stripping libraries is possible... yes
checking if libtool supports shared libraries... yes
checking whether to build shared libraries... yes
checking whether to build static libraries... no
configure: creating libtool
appending configuration tag "CXX" to libtool
checking for ld used by g++... /usr/i586-suse-linux/bin/ld
checking if the linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) is GNU ld... yes
checking whether the g++ linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) supports shared libraries... yes
checking for g++ option to produce PIC... -fPIC
checking if g++ PIC flag -fPIC works... yes
checking if g++ supports -c -o file.o... yes
checking whether the g++ linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) supports shared libraries... yes
checking dynamic linker characteristics... GNU/Linux ld.so
checking how to hardcode library paths into programs... immediate
checking whether stripping libraries is possible... yes
appending configuration tag "F77" to libtool
checking if libtool supports shared libraries... yes
checking whether to build shared libraries... yes
checking whether to build static libraries... no
checking for gfortran option to produce PIC... -fPIC
checking if gfortran PIC flag -fPIC works... yes
checking if gfortran supports -c -o file.o... yes
checking whether the gfortran linker (/usr/i586-suse-linux/bin/ld) supports shared libraries... yes
checking dynamic linker characteristics... GNU/Linux ld.so
checking how to hardcode library paths into programs... immediate
checking whether stripping libraries is possible... yes
configure: WARNING: you cannot build info or html versions of the R manuals
checking for cos in -lm... yes
checking for sin in -lm... yes
checking for dlopen in -ldl... yes
checking readline/history.h usability... no
checking readline/history.h presence... no
checking for readline/history.h... no
checking readline/readline.h usability... no
checking readline/readline.h presence... no
checking for readline/readline.h... no
checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
checking for main in -lncurses... no
checking for main in -ltermcap... no
checking for main in -ltermlib... no
checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
checking for history_truncate_file... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

Das sagt mir leider überhaupt nicht, was ich nun machen soll
und der weitere Schritt mit "make" macht das hier:

laptop:/usr/local/programs/R-2.4.0 # make
make: *** Keine Targets angegeben und keine »make«-Steuerdatei gefunden.  Schluss.

Da ich als Refferenz nur meine mitgelieferten Dokumentationen habe, und die mir nur sagen: machen sie ./configure und dann make, komme ich natürlich nicht weiter.

Ich bin euch echt Dankbar für Tipps, bräuchte das Program für mein Studium.

Danke, gruß Naich

 

[Keruskerfürst]

Es fehlen einige Programme zum kompilieren wie:
1. aclocal
2. autoconf
3. automake
usw.

 

[Lumpi]

Hallo

Kleiner Tipp:
überall, wo beim Kompilieren ein "missing" oder "no" steht,
fehlt der entsprechende Input.
Dann muss man entscheiden, ob dieser benötigt wird
und ihn gegebenenfalls nachinstallieren....

Gruß Lumpi

 

[gropiuskalle]

Wenn ein ./configure mit einer Fehlermeldung abschließt, brauchst Du make nicht bemühen; deswegen auch die Meldung der nicht gefundenen Steuerdatei.

Wieso holst Du Dir nicht das .rpm für Suse 10.1? Wenn es von YaST oder Apt nicht angeboten wird, kannst Du es doch als lokale Quelle einbinden und somit installieren (Das Paket gibt's mit mittelmäßigen Gekrame hier --> cran.r-project.org/.

Ansonsten empfehle ich Dir, nicht zu wild zu kompilieren, wenn Dir das grundsätzliche Prinzip noch nicht klar ist. Immerhin werden mit 'make install' ein unter Umständen ein paar hundert Ordner über Dein System verstreut und fest installiert, was beim eventuell notwendigen Deinstallieren Probleme schaffen kann, wenn man die nötige Orientierung nicht hat. Lieber die stinknormalen repos nutzen, wenn sie vorhanden sind.

 

[Naich]

Danke für die schnellen Antworten, ich sehe schon, dass ich mir gerade die rpm mal runterlade (bei meinem Internet kann das dauern), vielleicht probiere ich das mit dem compilieren noch mal wenn ich mehr Ahnung habe, da fehlt ja doch noch einiges.

Aber ihr habt da schonmal nen bisschen Klarheit in meinen Linux Dschungel gebracht, Danke euch!

Gruß

 

[gropiuskalle]

Hier nochmal die genaue Adresse zur Sicherheit: http://cran.r-project.org/bin/linux/suse/10.1/RPMS/i586/

Nach dem Install kannst Du ja mal nach 'checkinstall' googeln, damit wird das selberkompilieren weniger haarig, weil Du statt eines Installs damit erstmal ein .rpm baust, was Du dann in z.B. Apt lokal einbinden kannst (und dementsprechend bequem auch wieder deinstallieren).

 

[theton]

Der Vollständigkeit halber: Bei einem configure-Fehler kommt es meist auf die letzte Zeile an.

configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

Diese Zeile will dir sagen, dass das dir das devel-Paket von readline fehlt. Also einfach readline-devel installieren und configure nochmal durchlaufen lassen. Dieses "configure"->fehlendes devel-Paket installieren" macht man dann so lange, bis alle Abhängigkeiten aufgelöst sind.

 

[gropiuskalle]

Gelegentlich findet sich nach dem Entpacken eines tarballs auch eine Textdatei namens 'README', in der die zum Kompilieren benötigten Pakete aufgelistet sind.

 

[Naich]

Ich dachte ich bin x86_... ? oder muss ich es für i586? ich bin verwirrt und fast fertig mit dem download von der x86
Habe gerade erstmal die x86_64 datei versucht über Yast zu installieren. Das ging nicht, weil der das Packtet nicht gefunden hat (?)
Ist das also die falsche Version? Lade gerade das mit i586 runter und veruche es nochmal.

 

[gropiuskalle]

http://img93.exs.cx/img93/604/cotilleo2tj.gif Gib doch mal 'sysinfo:/' in die Adressleiste Deines Konnquerors.

 

[Naich]

Also nochmal nen Update:
Habe jetzt mit beiden rpms es versucht: ...i586.rpm und ....x86_64.rpm und bei beiden kam die Fehlermeldung bei Yast:

"Folgende Packete wurden auf dem Medium nich gefunden: R-base."

Das verstehe ich nicht, die liegt doch auf dem Desktop....hmmmm könnt ihr mir das erklären?

Danke gruß Naich

EDIT: @ gropiuskalle: meinst du bei Betriebssystem : ...... i686 , oder
System: SUSE LINUX 10.1 (i586)

 

[theton]

Versuchs mal mit 'rpm -U ~/Desktop/[name-der-rpm-datei]' auf der Konsole als root (also vorher mit 'su' root-Rechte holen).

 

[Naich]

Danke!
Ich bin wirklich Konsole Fan geworden. Da weiß man dann entlich was noch so fehlt. (wenn man sie erstmal bedienen kann )
Also nachdem ich nun noch blas, tk und tcl installiert habe, um (ich glaube das heißt) Abhängigkeiten zu klären, konnte ich mit

rpm -U ~/DEsktop/R-2.4.0.i586.rpm

das Programm installieren (habe ich doch oder ?).
Auf jeden funktioniert es jetzt.
Danke euch Allen.
Gruß Naich